بعد مرحلة المجموعات، تدخل بطولة أفريقيا للأندية البطلة في مرحلة الإقصائيات المباشرة، حيث يتم تحديد الفرق المتأهلة إلى ربع النهائي حسب البرنامج التفصيلي من دور الـ 16 على النحو التالي:
– ابتداءً من يوم السبت 26 أفريل 2025، ستبدأ المباريات المتقاطعة بين المجموعات لتحديد الفرق المتأهلة إلى ربع النهائي:
– يوم الأحد 27 أفريل 2025، ستنطلق مباريات ربع النهائي: حيث يتواجه المتأهلون الـ 8 من أجل الوصول إلى المربع الذهبي. ستكون المباريات محددة وفقاً لنتائج يوم السبت.
– يوم الاثنين 28 أفريل 2025، ستُقام مباريات نصف النهائي.
– يوم الثلاثاء 29 أفريل 2025: مباراة تحديد المركزين الثالث والرابع، تليها المباراة النهائية الكبرى لتحديد بطل أفريقيا 2025.